Parce qu'il a découvert qu'une gorgone a usurpé l'identité du roi d'Argos, le jeune Persée est contraint de s'enfuir avec sa nourrice Lydie. Poursuivis par le terrible Narkissos, ils font la connaissance d'Elias, un pirate de pacotille accompagné de Thalès et Pythagore, ses deux matelots surdoués, et de Popi, un inventeur excentrique sourd comme un pot. Tout les oppose et pourtant, ils vont devoir s'allier pour déjouer le piège tendu par Méduse.

La mère de Persée n'a pas pu échapper au sortilège de la gorgone ! Afin de la libérer de ce maléfice, le jeune prince se rend à Atlantide dans l'espoir de trouver des réponses auprès de son célèbre oracle. Accompagné de Lydie, Élias, Thalès et Pythagore, la fine équipe qui ne fait pas dans la dentelle, il reçoit un accueil... contrasté. Et tout s'emballe lorsqu'un mystérieux guerrier fait son apparition et ravive un passé aussi douloureux que mystérieux.

Dix ans se sont écoulés depuis l'invasion de Naboo. Anakin Skywalker est aujourd'hui l'apprenti du chevalier Jedi Obi-Wan Kenobi. Une tentative d'assassinat est commise sur l'ancienne reine de Naboo, la sénatrice Padmé Amidala, et la galaxie est au bord de la guerre civile. Anakin, désigné pour protéger la sénatrice, tombe amoureux de Padmé et commence à découvrir son propre côté obscur.

Des années après la guerre des clones, la République s'effondre, laissant place à l'Empire. Confirmant les plus grandes craintes du Jedi Mace Windu, Anakin Skywalker est séduit par le côté obscur de la Force, et devient Dark Vador le nouvel apprenti de l'empereur. Les Jedi sont anéantis, Obi-Wan Kenobi et le maître Jedi Yoda sont contraints de se cacher. Les propres enfants d'Anakin, un garçon et une fille, sont le seul espoir pour la galaxie. Âpre et ténébreux épisode...