1928, Paris. Découvert presque mort dans une ruelle, un jeune garçon est recueilli par une famille dans laquelle il découvre l'amour et la musique. Mais une ancienne promesse l'oblige à fuir. En 2008, sur la mer Egée, à bord du Titan, les sept sœurs, qui rendent un dernier hommage à leur père adoptif, Pa Salt, apprennent qu'il leur a dissimulé une grande partie de son passé.

Berlin 1942. Bruno a 9 ans, et vit avec ses parents et sa soeur dans une belle maison. Son père, un officier nazi, vient d'avoir une promotion et ils déménagent hors de Berlin. Bruno est triste de se retrouver loin de tout, dans une lugubre maison. De sa fenêtre, il peut voir des silhouettes d'hommes, de femmes et d'enfants, tous vêtus de pyjamas rayés. Personne ne veut lui expliquer qui ils sont.