Quittant le monde des herbes, Tobie Lolness part à la reconquête de l'arbre. Elisha est entre les mains de Léo Blue, l'ancien ami de Tobie, devenu son pire ennemi. Il règne sur un nid immense posé sur les cimes de l'arbre. Léo travaille à l'anéantissement du peuple de l'herbe tandis que Jo Mitch tient prisonniers les parents Lolness dans son terrible cratère.

Tobie Lolness mesure un millimètre et demi et appartient au peuple du grand chêne. Le père de Tobie, savant génial et sage, a refusé de livrer le secret d'une invention qui permet de transformer la sève de l'arbre en énergie motrice. Furieux, le Grand Conseil a condamné les Lolness à l'exil dans les basses branches, territoire sauvage. Tobie y rencontre Elisha qui devient son amie.